Zależy wszystko jak jest w skórce.
Albo w szablonie: ACP->Style i szablony->Nagłówek->Header i centrujesz w HTML.
Albo jeśli to warstwa ze zdefiniowanym stylem w css, to: ACP->Style i szablony->global css->logo i tam edytujesz właściwości wyrównania stylu.