W sumie to musiałbyś użyć mysqldump, ale to nie da się jako polecenie mysql, tylko polecenie powłoki (shella).
Jeżeli masz dostęp do phpMyAdmina, to w nim możesz łatwo wykonać kopię.
Jeżeli natomiast chcesz sobie to robić cyklicznie, to albo użyj jakiegoś skryptu w PHP, albo mysqldump jako skrypt powłoki odpalany cronem.